以 AI 與資料科學
推進癌症治療的實證研究

從多體學大數據到臨床應用 —— 打造可驗證的新型治療策略

實驗室使命

癌症治療正快速進入以資料與人工智慧驅動的新階段。本團隊為跨領域研究團隊,長期致力於轉譯數據科學癌症多體學AI 驅動藥物開發

我們從資料收集、分析到生醫實驗,深入探討 AI 如何實際影響癌症治療決策與新藥研發流程,解決生醫研究的核心挑戰。

陳璿宇博士照片

陳璿宇 博士 (Dr. Hsuan-Yu Chen)

  • 中央研究院 統計科學研究所 研究員
  • 國立臺灣大學/中興大學/高雄醫學大學 合聘教授
  • 台灣精準健康暨毒理基因體學會 理事長
  • 美國與台灣 Cancer Moonshot 國際研究團隊成員
轉譯數據科學 癌症多體學 AI 驅動精準醫療

研究核心方向

01. 資料科學與精準醫療

整合基因體、轉錄體與蛋白質體等高維度多體學資料,結合臨床大數據。

  • 建立可解釋、可應用的疾病風險預測模型
  • 開發治療反應預測模型
  • 研究成果實際推進至臨床研究與轉譯應用

02. 生成式 AI 與新藥設計

發展以 Generative AI 為核心的分子設計方法,建構可驗證的「分子設計智慧代理平台」。

  • Dry–Wet Loop: 結合細胞實驗、動物模型與質譜分析的「預測—驗證—回饋」架構
  • 建立可擴充的 AI 藥物設計流程
  • 挑戰傳統方法難以處理的癌症標靶

團隊與環境

我們是一個跨領域研究團隊,成員背景涵蓋臨床醫師、統計學者、資工/電機工程師與生物學研究人員。

3 博士後研究員
7 博士生
7 碩士級研究員

精選著作 (Selected Publications)

Ya-Hsuan Chang, Tzu-Chan Hong, Kuen-Tyng Lin,…,Hsuan-Yu Chen*, Sung-Liang Yu, Ming-Shiang Wu, Yu-Ju Chen, Integrative proteogenomics maps multifactorial aetiology, progression and therapeutic vulnerabilities in gastric cancer, Gut, doi: 10.1136/gutjnl-2025-337247 (IF: 26.2; Ranking: 4/148, 2.7%) Corresponding author
Shankha Satpathy, Natalie M. Clark, Yi-Ju Chen,…,Hsuan-Yu Chen*, Alexey I. Nesvizhskii, Steven A. Carr, D. R. Mani, Marcin P. Cieslik, Yu-Ju Chen, Michael A. Gillette, 2025, Integrative Analysis of Lung Adenocarcinoma Across Diverse Ethnicities and Exposures, Cancer Cell, 43: 1731-1757 (IF: 44.5; Ranking: 5/326, 1.5%) Corresponding author
Shih-Pin Chen, Ya-Hsuan Chang, Yen-Feng Wang, Hsuan-Yu Chen*, Shuu-Jiun Wang, 2025, Composite microRNA-genetic risk score model links to migraine and implicates its pathogenesis, Brain, 148: 2178-2188 (IF: 11.7; Ranking: 5/285, 1.8%) Corresponding author
Yi-Ju Chen, Theodoros I. Roumeliotis, Ya-Hsuan Chang,…,Hsuan-Yu Chen*, Pan-Chyr Yang, Yu-Ju Chen, 2020, Proteogenomics of Non-smoking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and Progression, Cell, 182, 226-244. (IF: 42.5; Ranking: 2/320, 0.6%) Corresponding author
Poyin Huang, Yuan-Han Yang, Ya-Hsuan Chang, Shu-Ling Chang, Mei-Chuan Chou, Chiou-Lian Lai, Ching-Kuan Liu, Hsuan-Yu Chen*, 2020, Association of early-onset Alzheimers disease with germline-generated high affinity self-antigen load, Translational Psychiatry, 10, 146. (IF: 6.2; Ranking: 21/288, 7.3%) Corresponding author
Chen HY, Yu SL, Ho BC,…,Chang GC, Yang PC, Li KC, 2015, R331W Missense Mutation of Oncogene YAP1 Is a Germline Risk Allele for Lung Adenocarcinoma With Medical Actionability., Journal of Clinical Oncology, 33, 2303-2310. (IF: 41.9; Ranking: 6/326, 1.8%)
Chen HY, Yu SL, Chen CH, Chang GC, Chen CY, Yuan A, Cheng CL, Wang CH, Terng HJ, Kao SF, Chan WK, Li HN, Liu CC, Singh S, Chen WJ, Chen JJ, Yang PC, 2007, A five-gene signature and clinical outcome in non-small-cell lung cancer., New England Journal of Medicine, 356, 11-20. (IF: 78.5; Ranking: 2/332, 0.6%)